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作 者:于夢佳1,劉思霞1,2,周雨1,張馨元1,任曉彤1,周永恒1,楊守莊1,3,李志剛1,4,徐艷春1,5,楊淑慧1
單 位:
東北林業(yè)大學(xué)野生動(dòng)物與自然保護(hù)地學(xué)院,哈爾濱, 150040
濮陽市油田第一中學(xué),濮陽, 457000
秦皇島野生動(dòng)物園,秦皇島, 066100
唐山動(dòng)物園,唐山, 063020
國家林業(yè)和草原局野生動(dòng)物保護(hù)與利用工程技術(shù)研究中心,哈爾濱,150040
引文信息:
于夢佳,劉思霞,周雨,等.羽翈中DNA和糖皮質(zhì)激素共提取技術(shù)的研究[J].野生動(dòng)物學(xué)報(bào),2024,45(4):800-810.
DOI:10.12375/ysdwxb.20240413
摘 要
羽毛是鳥類研究、監(jiān)測和管理中常用的非損傷性材料,可從中提取DNA和激素進(jìn)行遺傳和生理分析。
然而,作為高度角化的組織,羽翈中的DNA和激素含量極低,提取較為困難。
本研究開發(fā)一種能夠從羽翈中同時(shí)提取總DNA和糖皮質(zhì)激素的方法,命名為DH-CoEx。以丹頂鶴(Grus japonensis)、綠孔雀(Pavo muticus)為代表的大型鳥類廓羽、尾上覆羽和以栗鹀(Emberiza rutila)、小鹀(E.pusilla)為代表的小型鳥類飛羽、絨羽進(jìn)行測試和評(píng)估。
M. DL2000 DNA marker.
采用DH-CoEx提取的羽翈總DNA對(duì)不同長度mtDNA片段的擴(kuò)增效果
DH-CoEx在不同羽翈樣本中的mtDNA提取量
DH-CoEx在不同羽翈樣本中的微衛(wèi)星分型效果
DH-CoEx在不同羽翈樣本中的皮質(zhì)醇激素提取量
結(jié)果顯示:
DH-CoEx能有效從完全角化的羽翈中同時(shí)提取出總DNA及糖皮質(zhì)激素(皮質(zhì)醇);從5 mg樣本中提取的線粒體DNA(mtDNA)拷貝數(shù)達(dá)到104量級(jí),可支持長達(dá)1 350 bp的片段擴(kuò)增;所提取的核DNA(nuDNA)質(zhì)量足以進(jìn)行長達(dá)200 bp的微衛(wèi)星等位基因分型,成功率為98.11% ~ 99.60%;提取的皮質(zhì)醇含量達(dá)到了傳統(tǒng)單一提取激素方法的水平,足以進(jìn)行相關(guān)生理學(xué)分析。
以上結(jié)果說明,DH-CoEx是一種簡易、高效和適用性廣泛的方法,實(shí)現(xiàn)了角化材料總DNA和糖皮質(zhì)激素的共提取,可以支持mtDNA和微衛(wèi)星等分子標(biāo)記的分析和應(yīng)激激素的分析,極大地提高了羽毛的利用率,具有廣泛的應(yīng)用潛力。
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