保護區(qū)以巖溶中山南亞熱帶季風常綠闊葉林、亞熱帶山地苔蘚常綠闊葉林、野生動植物及其棲息地為主要保護目標。主要保護對象有以華蓋木為代表的多種木蘭科植物及伯樂樹、毛枝五針松等珍稀瀕危和特有植物類群和蜂猴、倭蜂猴、熊猴、云豹等珍稀瀕危野生動物。

保護區(qū)植被類型劃分為常綠闊葉林、落葉闊葉林、暖性針葉林、竹林、灌叢和稀樹灌草叢6個植被型，季風、半濕潤、中山濕性、苔蘚常綠等10個植被亞型18個群系21個群落，是云南省常綠闊葉林分異最完整的保護區(qū)之一，有高等植物233科1057屬3380種。

保護區(qū)生物多樣性極其豐富，記錄有國家重點保護野生植物121種，其中國家一級重點保護植物12種，國家二級重點保護植物109種，4個特有屬198個特有種，國家和云南省極小種群植物10種；國家一級重點保護野生動物13種，國家二級重點保護野生動物60種，國家“三有”動物357種。

保護區(qū)內(nèi)溪流眾多，涵養(yǎng)水源能力強，是一座天然的綠色水庫。