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陳劍平院士團(tuán)隊(duì)碩士研究生揭示長(zhǎng)鏈非編碼RNA編碼肽促進(jìn)病毒感染的新機(jī)制

媒體:植物脅迫與抗逆研究  作者:內(nèi)詳
專業(yè)號(hào):昆明市林草局 2025/4/30 15:52:28

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小麥黃花葉病毒(WYMV)嚴(yán)重威脅小麥安全生產(chǎn),闡明其致病機(jī)制對(duì)制定有效防控策略具有重要意義。已有研究表明,在多種生物體系中,長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)包含的小開(kāi)放閱讀框可編碼具有重要生物學(xué)功能的功能性小肽。盡管植物lncRNA來(lái)源的小肽已被證實(shí)參與生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控和逆境脅迫響應(yīng),但其在植物-病毒互作中的功能機(jī)制仍屬未知領(lǐng)域。

2025年4月17日,寧波大學(xué)陳劍平院士/羊健研究員團(tuán)隊(duì)在植物病理學(xué)領(lǐng)域經(jīng)典期刊Molecular Plant Pathology上發(fā)表題為“l(fā)ncRNA-Encoded Small Peptide Promotes Viral Infection”的研究論文,揭示了長(zhǎng)鏈非編碼RNA編碼的小肽促進(jìn)病毒感染的新機(jī)制。

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在這項(xiàng)研究中,基于WYMV脅迫下的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),作者鑒定到一個(gè)顯著受病毒誘導(dǎo)上調(diào)的lncRNA Talnc54748,并證實(shí)Talnc54748主要定位于細(xì)胞質(zhì)中。生物信息學(xué)預(yù)測(cè)結(jié)合分子實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,Talnc54748含有一個(gè)可翻譯的小開(kāi)放閱讀框,其編碼肽(命名為ORF4)受TaMYB86轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控并在WYMV侵染時(shí)特異性誘導(dǎo)表達(dá)。

為確定Talnc54748及其編碼肽的生物學(xué)功能,作者通過(guò)大麥條紋花葉病毒介導(dǎo)的基因沉默系統(tǒng)等實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)沉默Talnc54748顯著抑制WYMV的病毒積累。進(jìn)一步功能研究表明,過(guò)表達(dá)該小肽可顯著增強(qiáng)馬鈴薯X病毒的復(fù)制能力,且在NbORF4-OE轉(zhuǎn)基因植株中也表現(xiàn)出對(duì)WYMV更高的病毒敏感性,證實(shí)了該小肽是病毒侵染的正調(diào)控因子。

為闡明Talnc54748編碼肽抑制寄主免疫的分子機(jī)制,作者通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)ORF4過(guò)表達(dá)導(dǎo)致植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和MAPK信號(hào)通路關(guān)鍵基因(如NbSAUR21和NbMKK2)顯著下調(diào)。隨后的病毒誘導(dǎo)的基因沉默(VIGS)實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在本氏煙草和小麥中敲低SAUR21或MKK2均可顯著提高宿主對(duì)WYMV的易感性。此外,本研究還發(fā)現(xiàn)ORF4不僅能顯著促進(jìn)煙草花葉病毒和番茄花葉病毒的侵染,還促進(jìn)了辣椒疫霉和丁香假單胞菌的感染,暗示ORF4促進(jìn)病毒侵染具有廣譜性。

綜上所述,Talnc54748編碼肽通過(guò)拮抗植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和MAPK信號(hào)通路核心組分的表達(dá),形成有利于病毒增殖的宿主微環(huán)境。該研究首次揭示植物lncRNA編碼肽通過(guò)調(diào)控多重防御信號(hào)網(wǎng)絡(luò)促進(jìn)病毒侵染的分子機(jī)制,系統(tǒng)解析了該小肽在WYMV-小麥互作中的雙重調(diào)控功能:既作為病毒致病因子增強(qiáng)宿主易感性,又通過(guò)干擾免疫相關(guān)基因動(dòng)態(tài)平衡重塑抗病響應(yīng)。

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寧波大學(xué)植物病毒學(xué)研究所碩士研究生李瑤瑤為論文第一作者,劉芃副研究員為論文通訊作者。該研究得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2023YFD1400302和2022YFA1304402)、國(guó)家自然科學(xué)基金(32472495)、寧波市自然科學(xué)基金(2023J003)等項(xiàng)目的支持。

全文鏈接:https://doi.org/10.1111/mpp.70084

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